Kategoriler
Biyocoğrafya

The Effect of Recovery in Biodiversity on CCHFV!?

25 January 2020

In this paper (https://bit.ly/3bEY5KO), I focused on the distribution ecology of CCHFV as a case study. I used the data provided by a really good study (Orkun et al. 2017, https://bit.ly/30QnaOi). They sampled from 87 localities, and found CCHFV in 10 out of these localities. So, I used these 10 localities as presence data. Because I chose the algorithm MAXENT, I used all sampling localities (87 localities) to define the background area. It was defined by using a 15 km buffer applied to all sampling localities (87 localities). Five out of 14 environmental variables (including bioclimatic variables, consensus land cover, habitat heterogeneity, and cloud cover climatology) were used in a final model. Those variables were precipitation of the driest quarter, cloud cover (mean annual frequency), land cover (shrubs and herbaceous vegetation), and habitat heterogeneity (homogeneity). Using all combinations of the following feature classes [(1) L, (2) L and Q, (3) H, (4) L, Q, and H, and (5) L, Q, H, and P] and regularization multipliers (1 to 5 in increments of 1), different models were tested to determine the best/final model. These models were calibrated using a 10-fold cross-validation. Model performance and significance were good even when extrinsic test data (CCHF cases) were used. Herbaceous vegetation and habitat heterogeneity were the most significant variables.

After the above-mentioned paper, I noticed a database (including land use over the past 8000 years, http://ecotope.org/products/datasets/used_planet/). One of variables in the database is highly interesting: % Recovery from peak land use (may be considered to be an indicator of recovery in biodiversity!). So, I repeated all analyses using this variable also. This variable was the only most significant variable (see figures). Sure, sample size is low (but sampling design is strong), study area may be small to understand the distribution ecology of CCHFV, and recovery data may include some hidden information other than recovery in biodiversity! However, these results may support the hypotheses in the literature and that in the following paper: Spengler and Estrada-Pena (2018, https://bit.ly/352X9xx) discussed that “Abandoned agricultural areas become populated by large patches of natural flora, facilitating shelter for rodents, birds, wild suids, and wild ungulates. We hypothesize that the overpopulation of these key hosts increases the abundance of Hyalomma spp. ticks, which could fuel CCHFV prevalence rates in the vectors in a feedback mechanism. As more ticks become infected, the probability of infecting reservoirs and naïve ticks and of transmitting the virus to humans increases.”

Yazar Hakan GÜR

1993-2007 yılları arasında lisans, yüksek lisans ve doktora öğrenimini Hacettepe Üniversitesi, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü’nde tamamladı. Yüksek lisans ve doktora çalışmaları, sırasıyla Anadolu yer sincaplarının populasyon biyolojisi ve biyocoğrafyası ile ilgilidir. 2008 yılında Ahi Evran Üniversitesi, Fen-Edebiyat Fakültesi, Biyoloji Bölümü’ne atandı. 2009 yılında “Richardson yer sincaplarının yaşam öyküsü özellikleri ve fenolojisi üzerine iklimsel etkiler” başlıklı çalışması ile Lethbridge Üniversitesi (Alberta, Kanada), Fen-Edebiyat Fakültesi, Biyolojik Bilimler Bölümü’nün ‘Karasal Ekoloji Doktora Sonrası Araştırma Bursu’nu kazandı. Son yıllarda, yer sincaplarının ekolojisi ve biyocoğrafyası üzerine yaptığı çalışmalarını, moleküler filocoğrafya ve ekolojik niş modellemesi yaklaşımlarını kullanarak, küresel iklim değişikliklerinin omurgalı türlerinin coğrafi dağılımı ve genetik yapısını nasıl etkilediği/etkileyeceği üzerine yoğunlaştırdı. Genel olarak, Anadolu Biyocoğrafyası Araştırma Grubu altında, Anadolu’nun coğrafi ve iklimsel çeşitliliğinin biyolojik yaşamını nasıl şekillendirdiğini anlamaya çalışıyor. 

Bir cevap yazın

E-posta hesabınız yayımlanmayacak. Gerekli alanlar * ile işaretlenmişlerdir